天水市果树研究所为市属正县级事业单位，成立于1953年（前身为天水地区园艺试验区站，1979年5月改为天水市果树研究所），归口市农业农村局管理，主要职责是开展果树新品种、新技术引进、试验、示范和推广，从事果树种质资源收集、保存和利用，选育果树新品种，开展果树栽培、病虫害防控等技术研究与集成创新以及科技成果转化，为天水果品产业发展提供科技支撑和技术服务。单位地处市区南郊，距离市区13公里，占地3200亩，有果树试验园560亩。现有在职职工132人，其中正高级9人，副高级24人，中级35人，省、市领军人才3名。有内设机构11个，分别为办公室、党建科、科管科、苹果研究中心、樱桃研究中心、花椒研究中心、植保研究中心、生物技术研究中心、果品信息研究中心、园艺试验中心和渗金山林场。研究所是科技部国家星火计划农村区域科技成果转化中心、农业农村部国家现代苹果产业技术体系天水综合试验站依托单位、国家林业科技推广示范基地，国家农业科技创新联盟成员单位，甘肃省引进国外智力成果示范推广基地，甘肃省苹果种质资源库依托单位，津甘“双地”科技特派员工作站，2017年被命名为省级“文明单位”。